『Empires & Puzzles』では、すべての防衛チーム（レイドバトル、レイドトーナメント、戦争、マップステージなど）は非常にシンプルなAIによって制御されています。

このAIは高度な戦略的決定を下すことはできません。例えば、AIは必ずランダムにターゲットを選択し、また特殊スキルが使用可能になると即座に使用します。敵の防衛チームは、バトルにおいてこのような単純ミスをすることがあります。

こういったAIの戦略の欠点を補うために、すべての防衛チーム（プレイヤー自身のチームも含みます！）には、プレイヤーが操作するチームと戦闘する際に、わずかなボーナスが与えられます。このボーナスの一環として、防衛チームの英雄には毎ターン少量のマナが付与されるようになっています。